Sau khi thực hiện mô hình chính quyền hai cấp, sau sáp nhập, cấp xã mới sẽ có các phòng chuyên môn và trung tâm phục vụ hành chính công, đồng thời sẽ trực tiếp quản lý các đơn vị sự nghiệp công lập.
Với số lượng cấp xã lớn, sau sáp nhập giảm từ hơn 10.000 xuống chỉ còn hơn 2 nghìn xã, thời gian thực hiện không nhiều, đòi hỏi các các bộ, ngành và địa phương phải “vừa chạy vừa xếp hàng” để hoàn tất được lộ trình đề ra.