Dự kiến, tuyến đường sắt sẽ xây dựng mới 4 ga gồm Nam Sơn, Châu Cầu, Chí Linh mới và Cái Lân; cải tạo 8 ga hiện hữu, xây mới 19 cầu và nâng cấp 36 cầu dọc tuyến.
Bộ Giao thông vận tải ước tính cần thêm khoảng 4.000 tỷ đồng, nâng tổng vốn đầu tư dự án lên khoảng 8.300 tỷ đồng, tăng thêm 700 tỷ đồng so với mức ban đầu.
Tháng 5/2005, Bộ Giao thông vận tải khởi công dự án đường sắt Yên Viên - Phả Lại - Hạ Long - Cái Lân với tổng mức đầu tư hơn 7.600 tỷ đồng. Nhưng gần 2 thập kỷ, tuyến đường sắt vẫn đang dở dang, bỏ không gây lãng phí nguồn lực xã hội.
