Bị cáo Nguyễn Văn Thế (cựu Trưởng Ban Kỹ thuật 7 Công ty AIC) khai, sau khi tìm hiểu chi phí, cấu hình của một số thiết bị trong gói thầu thực hiện với Trung tâm VNCERT, ông được Chủ tịch Nguyễn Thị Thanh Nhàn yêu cầu "nâng giá" lên thêm 40%.
Không đủ năng lực tham gia dự thầu, Công ty Gene Việt thống nhất dùng pháp nhân Công ty Việt Á (Công ty Việt Á có 10% vốn góp trong Gene Việt) đại diện đứng tên liên danh và thực hiện các hoạt động đấu thầu giai đoạn 1 của dự án với Công ty AIC.
Bà Nguyễn Thị Thanh Nhàn trao đổi với Giám đốc Trung tâm CNSH TP. HCM nhằm được tạo điều kiện cho Công ty AIC tham gia, trúng thầu để thực hiện các gói thầu. Bà Nhàn hứa sẽ “gửi quà cám ơn Xô và các anh em”.
Sau khi ra quyết định khởi tố bị can, bắt tạm giam bà Nguyễn Thị Thanh Nhàn, Chủ tịch HĐQT kiêm Tổng Giám đốc Công ty AIC, cơ quan điều tra đã phát lệnh truy nã vì xác định bà Nhàn đã bỏ trốn.