Để tổ chức bộ máy phù hợp với việc sáp nhập đơn vị hành chính, Bộ Tài chính đề xuất tổ chức lại từ 20 chi cục thuế khu vực thành 34 đơn vị thuế ở cấp tỉnh, thành phố trực thuộc Trung ương; chuyển đổi 350 đội thuế cấp huyện thành tổ chức thuế cơ sở thuộc chi cục thuế tỉnh, thành phố.