Chùa Ba Vàng chỉ thực hiện báo cáo quản lý thu chi tiền công đức, tài trợ cho di tích và hoạt động lễ hội. Còn tiền công đức, tài trợ cho hoạt động tôn giáo "là vấn đề nội bộ của Giáo hội Phật giáo Việt Nam", không công khai.
Trước việc chùa Ba Vàng phản hồi chưa nhận được văn bản yêu cầu kiểm tra việc quản lý tiền công đức, UBND TP. Uông Bí đã kiểm tra quy trình việc chuyển nhận văn bản đồng thời yêu cầu nhà chùa báo cáo bổ sung.
Theo Bộ Tài chính, còn trên 50 di tích không có số liệu báo cáo (trong đó có chùa Ba Vàng ở Uông Bí thuộc di tích cấp tỉnh, được đánh giá có số thu công đức tốt).